Dès que des composantes organiques provenant de matières fécales humaines, des restes d'aliments ou des substances de nature similaire parviennent dans une canalisation, les micro-organismes commencent à les utiliser. Cette utilisation repose sur des processus très complexes. Un grand nombre de nouvelles substances apparaissent : d'une part de nouveaux organismes vivants et d'autre part des produits provenant du métabolisme de ces êtres vivants. Dès sa formation, l'eau usée est donc soumise à des processus de décomposition dont l'intensité et le déroulement dépendent à la fois de la nature de l'eau usée et des conditions environnantes.
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