Sur le terrain comme en laboratoire, la fiabilité d'une analyse repose avant tout sur les qualités d'un échantillon. Celles-ci diffèrent selon les paramètres recherchés et selon que l'on se trouve dans le milieu naturel ou en laboratoire, que celui-ci soit réalisé manuellement ou automatiquement. Ces dernières années, les matériels, dopés par la publication de normes, ont beaucoup progressé et permettent, pour peu que les procédures soient scrupuleusement respectées, d'obtenir des échantillons de qualité. Des difficultés subsistent cependant dans certains cas.
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